Joona –yhteisön alku sijoittuu vuoteen 2010. Lappeenrannan luterilaisten seurakuntien edetessä kirkon oppillisten uudistusten linjalla, kirkon uskosta elävät kristityt joutuivat toteamaan jääneensä vaille hengellistä kotia. Kuten myös muualla Suomessa, yritykset vaikuttaa tilanteeseen eivät tuottaneet tulosta. Pastori Petri Hiltunen kutsuttiin tukemaan paikkakunnan kristittyjä.
Turvatakseen apostolisen jumalanpalveluselämän jatkuvuuden joukko järjestäytyi vuoden 2011 joulukuussa Suomen Luther-säätiön jumalanpalvelusyhteisöksi. Keväällä 2012 Joona päätti yhdessä Imatran Joosua -yhteisön kanssa ottaa lisää vastuuta luterilaisen seurakuntaelämän jatkamisesta ja uudistamisesta Etelä-Karjalassa. Yhteisöt kutsuivat itselleen oman pastorin. Joulukuussa 2012 Joona täytti yksi vuotta.
Maaliskuussa 2013 Joona liittyi Suomen evankelis luterilaisen lähetyshiippakunnan jäseneksi. Nimi, Joona, tulee heprean kielestä ja tarkoittaa kyyhkystä. Raamatussa on Joonan kirja.